地基是沙丘2000的一个非常重要的建筑，它可以保障建筑的血量，向外蔓延建造远处的建筑等等。
沙丘2000的建筑如果完全不放置在地基上，他们只会有一半的血量，即使通过维修对损伤的建筑进行修复，该建筑也会持续受到来自沙漠环境的腐蚀性损伤降至一半血量，而如果将建筑的一小部分放在地基上，其初始血量将会提高，但依然会降至一半血量，如果该建筑全部放在地基上，则是一个初期满血并且不会受到腐蚀损伤的建筑。值得注意的是，由于发电厂带来的电力和其血量有关，没有造在地基上的发电厂初始发电量只有一半，修复后被腐蚀的过程中电力也会慢慢下降。此外，许多建筑的最下面一条区域是不需要地基的，例如发电厂虽然占了6格区域，但只有上方的四格需要地基。还有，MCV展开的主基地会自带9格地基。
大多数玩家最初接触游戏时总是会习惯将所有建筑造在地基上，这种玩法应对原版战役绰绰有余。但随着难度较高的同人地图的推广以及人人对战的推广和节奏地加快，地基渐渐被一些玩家舍弃。有时候为了初期快速发展，大部分建筑可以不使用地基，而当发展速度、成型速度变快了以后，往往战火是在地图中间而不是自己家里。实验表明，人人对战时，不造部分地基的玩家造兵量会远大于大规模使用地基的玩家，这样打下去，使用地基的玩家完全没有能力威胁到对方的基地，反而自己在正面战场会很艰难。
在人机时，某些较困难的地图hard难度下有时还是有必要造满地基的，特别是面对多个电脑的时候，没有地基的建筑在轰炸机、死亡之手导弹面前显得非常脆弱，一轮轰炸机下来可能家中的关键建筑全没了，一下子局势大劣而hard难度下的建筑又贵得要死，补回去很慢。特别是电厂如果被炸瘫痪的话，前方防御的导弹塔没电失灵直接崩盘。
电厂和炮塔通常一定需要地基，此外，人机时如果使用围墙防御的话，围墙也尽量造在地基上，人人对战的大后期或者FFA的对局，也应尽量将家中多补一些地基建筑。
地基还有一个重要作用是蔓延以便建造建筑，沙丘2000的可建筑范围设定是己方建筑的周围以及己方地基的周围，所以在不方便建造建筑蔓延的时候，可以使用地基蔓延到自己想要建造建筑的地方。特别是人机的时候，电脑是不会主动攻击地基的，利用地基可以开发出许多种奇特的打电脑的方法。
地基无法建造在已经造好地基的岩石上，因此如果某一区域已经造了别人的地基，该地基被打掉之前，是无法在该区域建造自己的地基的。
在科技等级提高以后，便可以建造9格的大地基，大地基可以满足所有建筑的需求。而且在某些特殊地形中，小地基可能无法蔓延上悬崖或穿过无法建造的区域，但大地基却能穿过那些区域。